O Agente Secreto ganhou dois prêmios no Globo de Ouro, nas categorias de Melhor Filme em Língua Não Inglesa e Melhor Ator de Drama, pelo desempenho de Wagner Moura. A produção brasileira também disputou na categoria Melhor Filme de Drama, mas acabou superada por Hamnet: A Vida Antes de Hamlet.
O longa dirigido por Kleber Mendonça Filho venceu em várias categorias em diferentes festivais de cinema, incluindo o Festival de Cannes, Festival de Cine de Lima e Festival de Cinema de Zurique. Com as novas estatuetas, o filme brasileiro chega à marca de 56 prêmios acumulados antes do Oscar.
Wagner Moura recebeu prêmios de Melhor Ator em vários festivais, incluindo o Globo de Ouro, Festival de Cannes e Newport Beach Film Festival. O filme também recebeu prêmios de Melhor Direção, Melhor Roteiro e Melhor Fotografia em diferentes festivais.
O Agente Secreto é um filme brasileiro que está concorrendo a vários prêmios, incluindo o Oscar, e já acumulou mais de 50 prêmios em diferentes festivais de cinema.